Rukye yaparken uyulması gereken koşullar ve uyarılar vardır, bunlar şunlardır:
1- Rukye Kur’an ve sünnete uygun, gerek yapılışıyla, gerek okunuşuyla tüm bidatlardan, şirklerden ve haramlardan uzak olmalıdır.
2- Duayı okuyan Müslümanın, Rab’bine sımsıkı sarılıp O'na tevekkül etmelidir ve Rukye’nin Allah’ın izni olmadıkça hiçbir etkisi olmadığını bilmelidir.
3- Rukye’yi dur bir deneyeyim diye değil, bilakis, okuyan da ve üzerine okunan da duaların tesirine inanmalıdır ve Rukyse’yele Allahın izniyle şifa bulacağına inanarak yapmalıdır.
4- Kur'anı Kerim’in, bütün ayetleri şifadır. Allah’u Tealâ şöyle buyurmuştur; (Biz, Kur'an’dan öyle bir şey indiriyoruz ki o, müminler için şifa ve rahmettir.)
5- Hastanın kendi üzerine Rukye yapması daha hayırlıdır, çünkü Rab’bine olan acizliğini ve muhtaçlığını kendisi daha ihlaslı gösterebilir ve böylelikle Rukye’nin tesiri artar.